Az ügyész a közhasznú szervezetekkel kapcsolatos speciális jogköre alapján indítványozhatja a bíróságnál a szervezet törlését a közhasznú nyilvántartásból. Az indítványra azonban csak akkor kerülhet sor, ha a törvényellenes működést vagy a vagyonfelhasználást a szervezet az ügyész felszólítására sem szüntette meg.

A közhasznú jogállás megszűnéséről a bíróság az ügyész indítványára vagy a szervezet kérelmére dönt. A közhasznú szervezet hatvan napon belül köteles kérni a közhasznú nyilvántartásból való törlését, ha működése a közhasznúsági feltételek valamelyikének nem felel meg.

Az ügyészség indítványa alapján a bíróság akkor is megszünteti a közhasznú jogállást, ha a szervezet határidőn belül nem, vagy nem megfelelő tartalommal teszi közzé a számviteli beszámolóját, vagy a beszámoló alapján megállapítható, hogy nem teljesülnek a közhasznú jogállás feltételei.

A bíróság a szervezet kérelméről vagy az ügyész indítványáról nem peres eljárásban, soron kívül határoz. A bírósági határozat ellen fellebbezésnek van helye.

A közhasznú szervezet a közhasznú jogállásának megszűnésekor köteles esedékes köztartozásait rendezni, illetve közszolgáltatás ellátására irányuló szerződéséből eredő kötelezettségeit időarányosan teljesíteni.